机电工程系设有机电一体化(高职)和机电技术应用、数控技术应用、风电场设备运行与维护、机电设备安装与维护、金属加工与焊接等中职专业,建有数控技术和电工电子技术两个省高水平示范性实践基地,2016年机电专业群被评为江苏省“十三五”首批现代化专业群。
    系部拥有正高职称1人,副高职称专任教师46人,90%以上的专业教师具有双师素质,实习指导老师多数来源于企业,具有丰富的企业实践经验,现有南通市学科带头人2人,市骨干教师5人,县学科带头人3人,骨干4人。高级技师8人,技师32人。
   积极推行现代学徒制试点,学生培养实施校企合作、工学交替的人才培养模式,在与中天科技集团、汉能风电、如通石油机械、海装风电等公司签订订单培养协议的基础上,加强国际合作,目前已与德国bbw教育集团、奥地利帕尔菲格公司合作办班,联合培养高素质复合型技能人才,为地方经济的发展提供人才支撑。